Muhasebat Genel Müdürlüğünün 27/01/2016 tarih ve 05-827 sayılı yazıları ile, e-Fatura ve e-Arşiv Faturalarının, Merkezi Yönetim Harcama Belgeleri Yönetmeliği hükümlerine göre kanıtlayıcı belge kabul edilip edilmeyeceği konusunda açıklama yapılmıştır.
Buna göre; konu hakkında düzenleme yapılıncaya kadar 5018 sayılı Kanuna ekli cetvellerdeki idarelerce;
1) e-Fatura uygulamasına kayıtlı mükelleflerden mal teslimi veya hizmet ifası durumunda, genel hükümler çerçevesinde düzenlenmiş kâğıt fatura ödeme belgesine bağlanacaktır.
2) e-Arşiv Fatura uygulamasına kayıtlı mükelleflerden mal teslimi veya hizmet ifası durumunda, harcama birimlerince Gelir İdaresi Başkanlığının http://www.efatura.gov.tr/earsivsorgula.html adresinden sorgulanarak ilgili birim yetkilisinin adı, soyadı, unvanı, imzası ve resmi mühür ile onay tarihini taşıyan kâğıt ortamındaki e-Arşiv Fatura ödeme belgesine bağlanacaktır.
3) Harcama birimlerinde mevcut olup muhasebe birimlerine teslim edilecek veya muhasebe birimlerine teslim edilmiş ancak henüz ödemesi gerçekleştirilmemiş e-Arşiv Faturalar, harcama birimlerince Gelir Ġdaresi Başkanlığının http://www.efatura.gov.tr/earsivsorgula.html adresinden sorgulanacak ve ilgili birim yetkilisinin adı, soyadı, unvanı, imzası ve resmi mühür ile onay tarihini taşıyacak şekilde ödeme belgesine bağlanarak muhasebe birimine verilecektir.